Lo importante en primer término; !Bien Llegado a Casa!
Comentar, es demasiado vago lo expuesto. Eso puede provocar que la mayoría de las respuestas o comentarios vayan en el sentido de revisar las legislaciones aplicables, es decir, lectura completa de LIVA y LIEPS. Si fuera factible realizar un planteamiento más focalizado o puntualizado de las dudas que se tengan, te aseguro vas a recibir mejores comentarios.
El IEPS se paga a la entidad federativa, Recaudación de Rentas (por lo general), vencimientos mensuales, es de fácil fiscalización, ya que hay un proveedor único y al poder establecer con precisión lo que se compra, nada complicado resulta determinar lo que se vende. Hay en la actualidad varios empresarios del ramo que se encuentran promoviendo amparos (bueno, los abogados de ellos) para eliminarse la obligación del pago de IEPS, con argumentos diferentes pero con el mismo resultado, yo soy contador y respetuoso de los campos de acción, si estoy enterado es por ser algo de lo que como parte del equipo de asesores externos me toca conocer. Pero sin tener un conocimiento completo del tema, vamos a confiar que alguno de los múltiples abogados que nos visitan y distinguen con su presencia pueda ahondar en el tema.