La cuenta que usualmente denominamos Depreciacion Acumulada de (el activo en cuestion) es una cuenta complementaria de activo fijo, de naturaleza contraria a estos, es decir, toda vez que las cuentas de activos fijos son deudoras, las complementarias seran acreedoras.
Dependiendo de la practica contable que tengan pueda ser que registren mensualmente las depreciaciones, en algunos lugares se estila realizar su registro una vez al año.
Conviene recordar que la depreciacion (activos fijos) o amortizacion (gastos diferidos) es la "reparticion del costo" o el reconocimiento de los mismos en los resultados de la entidad. Por lo que su registro contable es con cargo a cuentas de resultados (Gastos Generales, Administracion, Venta, Produccion segun el caso) y abono a la cuenta complementaria de activo (Depreciacion Acumulada del activo en cuestion).
En lo referente al lado fiscal del tema, conviene recordar que las deducciones de ambito exclusivo fiscal se registran en contabilidad mediante el empleo de cuentas de orden, hay quienes realizan el registro en forma, digamos global. Cargo a Deduccion Fiscal de Inversiones con abono a Inversiones Fiscalmente Deducibles, hay quienes lo registran con mayor detalle, por ejemplo; cargo a Deduccion Actualizada/Fiscal de Equipo de Computo y abono a Actualizacion de Deduccion Fiscal de Equipo de Computo.
En todo momento la sugerencia es revisar ejercicios anteriores para ver la forma y politica que han seguido.
Registrar la depreciacion contable en gastos no es opcional, es obligatorio, pero debes cuidarte de no considerarle como una Deduccion Fiscal, ya que fiscalmente tiene su trato distinto. Conviene revises una declaracion anual (formato) para que constates que ambas son partidas de conciliacion de resultados.
Espero no haber enredado demasiado el asunto.
saludos