Me llama la atención que no cites que ya se pasó a Régimen General, pues si tan solo las compras son de $400,000 mensuales, es lógico esperar que sus ventas sean mayores o al menos para cubrir eso y los gastos del negocio. Eso haría que sus ingresos anuales superen los $5'000,000.00 y el ser intermedio no le correspondería.
Por otro lado, hazle caso a bandido y LOBOZAC, pues si la responsabilidad no es tuya, no hay razón para que la asumas. Ofrece hacer el mejor esfuerzo, pero sin garantía.
Respecto al plazo, si es posible pedir una ampliación del mismo hasta por 10 días hábiles más, pero hay que solicitarlo antes de que venza el plazo original indicado por la autoridad revisora.
En cuanto a que no pagó con cheque... malo, malo, malo. ya no lo puede subsanar y ese será su mayor (y muy mayor) problema, por eso la recomendación de no comprometerse a nada. Se debería hablar con la autoridad superior para intentar (casi seguro que sin lograrlo) que dicho requisito lo reduzca lo más que pueda, pero...
Como aún es invitación (o así lo entiendo yo) todavía no hay plazos legales y tienes tiempo de ayudar en lo que puedas, que sería hacer su contabilidad y sus cumplimientos fiscales. Cuando lo requieran formalmente o inicien la visita domiciliaria, presentan todo y... .... a rezar, pues el costo de esa auditoría, por los datos que citas, será astronómica.
Creo que deberían contratar un muy buen fiscalista (pero de veras bueno) pues es de esperarse que le determinen casi todo el ingreso como utilidad, pues si las facturas de compra por valores elevados los hizo no deducibles al pagar con efectivo, los demás gastos seguramente ni siquiera tendrán comprobantes.
Es todo un reto "entrarle" así que si después de pensarlo "siete veces siete" decides tomarlo, asesórate para no resultar "embarrado" en la situación que se presente.
Hasta luego.
