TRABAJADOR COTIZANDO CON NUM IMSS DIFERENTE

HOLA BUENAS TARDES
DE NUEVO CON UNA DUDA Y PROBLEMA GIGANTE,OJALA ME PUEDAN ORIENTAR CON UNA SOLUCION:
EN EL 2006 SE DIO DE ALTA UN EMPLEADO EN LA EMPRESA CON UN NUMERO DE AFILIACION XX , POR ERROR SE LE INSCRIBIO EN EL SUA , NOMINAS Y EN EL MISMO IMSS CON UN NUMERO DE AFILIACION IMSS DIFERENTE AL QUE EL EMPLEADO PROPORCIONO , PERO CON EL NOMBRE CORRECTO DEL TRABAJDOR,,,,,TODO ESTE TIEMPO SE HA PAGADO LAS CUOTAS DEL EMPLEADO PERO CON UN NUMERO DIFERENTE DE AFILIACION...
EL TRABAJADOR SE DIO CUENTA AL ENTRAR A LA PAGINA DE INFONAVIT CON EL NUMERO DE AFILIACION QUE EL TENIA Y PUES NO HABIA INFORMACION, DE HECHO ESE NUM DE AFIL ES INCORRECTO YA QUE NO TIENE SU FECHA DE NACIMIENTO EXACTO

COMO LE HAGO PARA CORREGIR TODOS LOS PAGOS Y HACERLOS AL NUMERO DE AFIL CORRECTO?
NECESITO ACUDIR A OFICINAS DE INFONAVIT Y DE IMSS?

MUCHAS GRACIAS DE ANTEMANO

Urge acudir escrito libre en mano en el que se explique lo acontecido, resulta de resaltar el que el aviso de inscripcion no haya sido rechazado por "error en el nombre", ya que se supone es uno de los filtros del IDSE... igual comentar que de no realizar en este instante las acalaraciones pertinentes en un futuro no lejano se veran sujetos a requerimiento tanto del IMSS como el INFONAVIT por la omision del pago de cuotas en favor del trabajador...

Por cierto, en la EMA y EBA que emite el instituto, ¿que NSS aparece para el trabajador?, ¿que nombre aparece?.

gracias por los comentarios..
Ya verifique que el error esta en la empresa patronal, es aqui donde se le dio de alta ( EN EL SUA) con un numero YY diferente pero muy parecido .

en su afores tiene el numero XX, igual lo tiene en la liquidacion de IMSS que me llegan, el XX, y las de INFONAVIT

Pues a mi ver urge la aclaracion por escrito libre, ya que si como indicas la EMA y la EBA contienen los datos correctos y es solo error de la parte patronal al alimentar los datos al SUA, mas tarde que temprano les van a notificar diferencias, con multa y accesorios incluidos.

Aparte de lo comentado por el buen gil le sugiero niza que el trabajador vaya viendo que pasa con el tramite de unificacion con su afore
Incisto aparte de lo comentado del escrito
saludos