INVALIDEZ EL PATRON PAGA?

Soy representante de una empresa, un empleado tiene una ST4 por invalidez (enfermedad general) pero no cumple con las semanas cotizadas del IMSS y le negó la pensión, el trabajador no puede trabajar, el IMSS ya no le da incapacidades por lo que el IMSS ya no le paga, no lo puedo dar de baja, que se hace en este caso? pago su cuota al IMSS sin pagarle salario? se le paga integro su salario? la regreso a trabajar aunque no haga nada?