Cálculo de ISR cuando se obtienen ingresos exentos

En primer lugar, agradecer la atención que se sirvieron prestar a mi consulta, con oportundiad y certidumbre.
Con lo obervado, entiendo que al obtener ingresos exentos, las deducciones autorizadas sufren un decremento en la proporción que se obtiene de aplicar lo establecido en el art. 32 de la Lel del ISR.
Pero lo que me sorprende es que en el SAT me digan que eso no aplica; siendo que es algo que obliga al contribuyente a tener una mayor carga fiscal.
Pienso hacer una nueva consulta, les voy a mencionar los fundamentos aquí mencionados, y a ver qué me dicen.
Muchas gracias.